1976年7月，为妥善安置盲人就业，经市革委批准建立“济南市盲人按摩诊所”，性质为自收自支、自负盈亏的集体所有制事业单位。
　　1995年10月,市编办批准更名为“济南市按摩医院”，编制45人，全民所有制事业单位，实行预算差额管理。
　　2006年6月，成立济南市残疾人中医康复中心，开始开展脑瘫康复项目，并承担省、市残联下达的康复救助任务。
　　2007年12月，被中国残联确定为“长江新里程计划”项目全国脑瘫儿童引导式教育定点机构。
　　2009年3月，与济南市市级机关事务管理局签订《资产转让协议》，市级机关事务管理局把位于经六路136号宗地、地上建（构）筑物及附属设施转让给医院使用。
　　2010年8月，完成了新址大楼的装修改造，搬迁新址。
　　2010年10月14日，济南市中医管理局组织专家对医院进行评审，医院取得了二级中医专科医院执业资格。
　　2010年10月15日，成功举办了新址落成典礼及全国按摩医院院长论坛。
　　2011年3月，与济南市医保办签订了协议，正式成为济南市城镇职工基本医疗保险（综合）定点机构。
　　2011年6月，被中国残联确定为全国脑瘫儿童引导式教育培训基地。
　　2011年12月3日，医院被中国残联确定为“全国盲人医疗按摩规范化实训基地”、被山东中医药大学学定为“山东中医药大学教学科研基地”、被长春大学特教学院确定为“长春大学特殊教育学院实习医院”。
　　2012年1月，被济南市卫生局确定为济南市新型农村合作医疗定点医院。
　　2013年10月，经市卫生局批准加挂第二名称“济南市颈肩腰腿康复医院”。
​2016年6月16日，济南市卫计委、财政局、人社局、物价局四部门联合下发《关于将市优抚医院等三家医院纳入全市公立医院综合改革的通知》，将医院纳入全市公立医院综合改革范围，市编办明确医院人员控制总量为100名。